北京大学电子信息科学基础实验中心是北京大学校级实验中心之一。面向全校电类/非电类共12个院系的学生，提供20门实验课程的教学服务。

电子信息科学基础实验中心实行以学校、学院为主的管理体制。学校实验室与设备管理部是中心的归口管理部门，负责中心的实验室建设与管理、仪器设备固定资产的管理、实验技术队伍的建设与管理等；学校教务部是中心的教学管理部门，负责与教学业务有关的管理，提供中心日常的教学经费等；信息科学与技术学院是中心直接的行政与教学管理部门，负责中心工作岗位或机构的设立，实验教学队伍的建设与管理，实验课程体系的建设，实验课程质量监督等。

实验中心实行主任负责制。设主任1名（学校任命），负责中心的全面工作；副主任2名，分别负责中心的教学和实验室管理工作。

中心设5大类实验室：电路基础类、电路系统类、EDA类、专业基础类和创新实验室，共18个实验室。每类实验室设实验室主任1名，并配备实验室管理人员，辅助实验教学。根据实验课程规模要求，组织实验教师队伍。

信息学院根据中心所承担的教学任务设置工作岗位。实验室建设、管理等教辅工作设立专职岗位，实验教学指导设立专职/兼职岗位。所有岗位人员实行公开招聘、定期考核的管理制度。

实验课程管理实行主持人负责制。主持人负责组织其课程组进行实验课程的建设、改革和授课，课程质量受学院督导组和学生课程评估的评价与监督。实验教师队伍由专职人员和来自各个学科专业的兼职人员组成，使得理论课与实验教学、教学与科研相互促进，达到人力资源的有机结合和利用。

实验室建设、仪器设备配置实行统一规划、专家论证，建设经费由学校实验室与设备管理部进行管理。日常实验教学经费根据实际教学规模由教务部划拨，并由中心进行统一管理和支配。